Serialul prezintă povestea intrigantă a lui Michael Scofield, interpretat de seducătorul Wentworth Miller, care înscenează jaful unei bănci pentru a ajunge în aceeași închisoare în care se află fratele său mai mare, Lincoln Burrows (Dominic Purcell). Așteptându-și rândul pentru scaunul electric după condamnarea în cazul unei crime pe care nu a comis-o, Lincoln se trezește coleg de închisoare cu fratele lui, în penitenciarul Fox River. Michael pune în aplicare, pas cu pas, un plan elaborat de evadare pentru el și fratele sau. Povestea se complică atunci când la mijloc intervin interese financiare și politice, dar și conspirații guvernamentale.
Inginerul constructor Michael Scofield se lasă arestat pentru a putea plănui evadarea fratelui său, un deținut condamnat la moarte și victimă a unei aparente înscenări.
Michael încearcă să obțină două obiecte: un drog care îi poate ajuta să iasă pozitiv la testul pentru diabet și un bolț pe care îl poate folosi în planul de evadare.
Michael are probleme în a-i convinge pe Abruzzi și Sucre să facă parte din planul său. Lincoln se gândește dacă să cheme un membru al familiei să asiste la execuție.
Michael obține niște chimicale caustice pe care le poate folosi în evadare. Haywire, noul coleg de celulă al lui Michael, este fascinat de tatuajele acestuia.
Planul lui Michael de a câștiga timp prin închiderea totală a blocului de detenție duce la o adevărată revoltă. Kellerman angajează un deținut care să-l ucidă pe Lincoln.
În timpul revoltei, Michael o salvează pe Sara, asasinul încearcă să îl ucidă pe Lincoln, iar Bellick nu ține cont de ordinele lui Pope și discută cu guvernatorul.
Michael caută o soluție pentru a ajunge din tunel în magazia care este și camera de odihnă a unui gardian. Kellerman și Hale încearcă să îi ucidă pe Veronica și pe LJ.
Pentru a recăpăta controlul producției și a-și recâștiga șansele de evadare, Abruzzi îl determină pe Michael să îi spună lui Falzone unde să îl găsească pe Fibonacci.
Lincoln îl avertizează pe Michael că vor fi nevoiți să renunțe la cineva din grup. Ulterior, Abruzzi îl amenință pe T-Bag că îl va ucide dacă nu va părăsi grupul.
Michael încearcă să întârzie execuția lui Lincoln stricând circuitul scaunului electric. Veronica și Nick încearcă să obțină deshumarea trupului lui Steadman.
Execuția este amânată când judecătorul cere deshumarea trupului lui Steadman. Sucre cere cuiva un favor pentru a-l ajuta pe Michael să verifice noua cale spre infirmerie.
Michael încearcă să îl facă pe Haywire să își amintească bucata lipsă din tatuaj. Ceilalți membri ai echipei vor să împiedice scoaterea la licitație a celulei acestuia.
Michael caută o idee prin care să obțină cheia infirmeriei de la Sara. Lincoln află despre implicarea tatălui său în evenimentele care i-au distrus viața.
Odată ce Bellick descoperă gaura săpată, deținuții trebuie să pună în aplicare planul evadării. Dar Lincoln este supravegheat non-stop și ar putea fi lăsat în urmă.